Après quelques tours préliminaires, voici 48 équipes qui vont se disputer la seconde phase, grâce à 12 groupes de quatre, permettant de qualifier les deux premiers de chacun des groupes.
Constitution des groupes:
Groupe A: Ajax Amsterdam, Anderlecht, Dinamo Zagreb, FC Timisoara
Groupe B: Valence CF, Lille, Slavia Prague, Genoa
Groupe C: Hambourg SV, Celtic Glasgow, Hapoel Tel-Aviv, Rapid Vienne
Groupe D: Sporting Portugal, Heerenveen, Hertha Berlin, Ventspils
Groupe E: AS Rome, FC Bâle, Fulham, CSKA Sofia
Groupe F: Panathinaïkos, Galatasaray, Dinamo Bucarest, Sturm Graz
Groupe G: Villarreal CF, Lazio Rome, Levski Sofia, SV Salzbourg
Groupe H: Steaua Bucarest, Fenerbahçe, Twente, Sheriff Tiraspol
Groupe I: Benfica, Everton, AEK Athènes, BATE Borisov
Groupe J: Shakhtar Donetsk, FC Bruges, Partizan Belgrade, Toulouse
Groupe K: PSV Eindhoven, FC Copenhague, Sparta Prague, CFR Cluj
Groupe L: Werder Brême, Austria Vienne, Athletic Bilbao, Nacional Madère
Cette phase se tiendra du jeudi 17 Septembre jusqu'à la mi-Décembre. Toutes les équipes se rencontre en allé retour dans chacun des groupes.
Constitution des groupes:
Groupe A: Ajax Amsterdam, Anderlecht, Dinamo Zagreb, FC Timisoara
Groupe B: Valence CF, Lille, Slavia Prague, Genoa
Groupe C: Hambourg SV, Celtic Glasgow, Hapoel Tel-Aviv, Rapid Vienne
Groupe D: Sporting Portugal, Heerenveen, Hertha Berlin, Ventspils
Groupe E: AS Rome, FC Bâle, Fulham, CSKA Sofia
Groupe F: Panathinaïkos, Galatasaray, Dinamo Bucarest, Sturm Graz
Groupe G: Villarreal CF, Lazio Rome, Levski Sofia, SV Salzbourg
Groupe H: Steaua Bucarest, Fenerbahçe, Twente, Sheriff Tiraspol
Groupe I: Benfica, Everton, AEK Athènes, BATE Borisov
Groupe J: Shakhtar Donetsk, FC Bruges, Partizan Belgrade, Toulouse
Groupe K: PSV Eindhoven, FC Copenhague, Sparta Prague, CFR Cluj
Groupe L: Werder Brême, Austria Vienne, Athletic Bilbao, Nacional Madère
Cette phase se tiendra du jeudi 17 Septembre jusqu'à la mi-Décembre. Toutes les équipes se rencontre en allé retour dans chacun des groupes.